PSO considère que l'innovation stimule considérablement le travail effectif et durable de renforcement de capacités.
C'est la raison pour laquelle PSO a fait de l'innovation l'un de ses fers de lances jusqu'en 2010.
PSO souhaite ainsi pousser les organisations membres à rechercher de façon active de nouvelles approches, de nouveaux modèles et de nouvelles méthodes de renforcement de capacités.
Cela revient par exemple pour les organisations membres à rechercher de nouvelles idées, de nouveaux terrains (géographiques) de travail ou de nouveaux groupes cibles, tels que les migrants.
Pour stimuler l'innovation, PSO fait appel à plusieurs instruments tels que le financement, la documentation et les activités collectives. L'un de ces instruments est le Fonds pour l'innovation (Innovatiefonds), spécialement créé pour financer les projets innovants.
PSO organise en outre une série de sessions d'inspiration pour les cadres et décideurs stratégiques des organisations membres et autres intéressés. Avec ces sessions, PSO espère pouvoir créer plus d'espace pour l'innovation chez les membres.